樣板程式碼縮減與模板#
使用 FYPP 綁定通用介面#
f2py
目前不支援綁定介面區塊。然而,目前有一些替代方案。其中最廣為人知的是使用 tempita
來使用 .pyf.src
檔案,如同 scipy 的綁定 中所做的那樣。tempita 支援已被移除,且在任何情況下都不再建議使用。
注意
介面無法在 f2py
本身中被支援的原因,是因為它們不對應到編譯後程式庫中輸出的符號。
❯ nm gen.o
0000000000000078 T __add_mod_MOD_add_complex
0000000000000000 T __add_mod_MOD_add_complex_dp
0000000000000150 T __add_mod_MOD_add_integer
0000000000000124 T __add_mod_MOD_add_real
00000000000000ee T __add_mod_MOD_add_real_dp
在此我們將討論一些技術,以結合 f2py
與 fypp 來模擬通用介面,並簡化多個(相似)函式的綁定。
基本範例:加法模組#
讓我們以使用者指南中的範例(F2PY 範例)為基礎,該範例是一個子程序,它接收兩個陣列並傳回它們的總和。
C
SUBROUTINE ZADD(A,B,C,N)
C
DOUBLE COMPLEX A(*)
DOUBLE COMPLEX B(*)
DOUBLE COMPLEX C(*)
INTEGER N
DO 20 J = 1, N
C(J) = A(J)+B(J)
20 CONTINUE
END
我們將把這個範例改寫成現代 Fortran
module adder
implicit none
contains
subroutine zadd(a, b, c, n)
integer, intent(in) :: n
double complex, intent(in) :: a(n), b(n)
double complex, intent(out) :: c(n)
integer :: j
do j = 1, n
c(j) = a(j) + b(j)
end do
end subroutine zadd
end module adder
我們可以像原始範例一樣繼續下去,手動添加 intents 等等,但是在生產環境中,通常還有其他考量。其中之一是,我們可以透過 FYPP 模板化相似函式的建構。
module adder
implicit none
contains
#:def add_subroutine(dtype_prefix, dtype)
subroutine ${dtype_prefix}$add(a, b, c, n)
integer, intent(in) :: n
${dtype}$, intent(in) :: a(n), b(n)
${dtype}$ :: c(n)
integer :: j
do j = 1, n
c(j) = a(j) + b(j)
end do
end subroutine ${dtype_prefix}$add
#:enddef
#:for dtype_prefix, dtype in [('i', 'integer'), ('s', 'real'), ('d', 'real(kind=8)'), ('c', 'complex'), ('z', 'double complex')]
@:add_subroutine(${dtype_prefix}$, ${dtype}$)
#:endfor
end module adder
這可以預先處理以產生完整的 Fortran 程式碼
❯ fypp gen_adder.f90.fypp > adder.f90
不出所料,這可以隨後被 f2py
包裝。
現在我們將考慮在單獨的檔案中維護綁定。請注意以下基本的 .pyf
,它可以透過 f2py -m adder adder_base.f90 -h adder.pyf
為單個子程序生成
! -*- f90 -*-
! Note: the context of this file is case sensitive.
python module adder ! in
interface ! in :adder
module adder ! in :adder:adder_base.f90
subroutine zadd(a,b,c,n) ! in :adder:adder_base.f90:adder
double complex dimension(n),intent(in) :: a
double complex dimension(n),intent(in),depend(n) :: b
double complex dimension(n),intent(out),depend(n) :: c
integer, optional,intent(in),check(shape(a, 0) == n),depend(a) :: n=shape(a, 0)
end subroutine zadd
end module adder
end interface
end python module adder
! This file was auto-generated with f2py (version:2.0.0.dev0+git20240101.bab7280).
! See:
! https://web.archive.org/web/20140822061353/http://cens.ioc.ee/projects/f2py2e
帶有 docstring
c = zadd(a,b,[n])
Wrapper for ``zadd``.
Parameters
----------
a : input rank-1 array('D') with bounds (n)
b : input rank-1 array('D') with bounds (n)
Other Parameters
----------------
n : input int, optional
Default: shape(a, 0)
Returns
-------
c : rank-1 array('D') with bounds (n)
這已經相當不錯了。然而,n
根本不應該被傳遞,所以我們將做一些小的調整。
! -*- f90 -*-
! Note: the context of this file is case sensitive.
python module adder ! in
interface ! in :adder
module adder ! in :adder:adder_base.f90
subroutine zadd(a,b,c,n) ! in :adder:adder_base.f90:adder
integer intent(hide),depend(a) :: n=len(a)
double complex dimension(n),intent(in) :: a
double complex dimension(n),intent(in),depend(n) :: b
double complex dimension(n),intent(out),depend(n) :: c
end subroutine zadd
end module adder
end interface
end python module adder
! This file was auto-generated with f2py (version:2.0.0.dev0+git20240101.bab7280).
! See:
! https://numpy.dev.org.tw/doc/stable/f2py/
這對應到
In [3]: ?adder.adder.zadd
Call signature: adder.adder.zadd(*args, **kwargs)
Type: fortran
String form: <fortran function zadd>
Docstring:
c = zadd(a,b)
Wrapper for ``zadd``.
Parameters
----------
a : input rank-1 array('D') with bounds (n)
b : input rank-1 array('D') with bounds (n)
Returns
-------
c : rank-1 array('D') with bounds (n)
最後,我們可以以類似的方式對其進行模板化,以達到最初的目標,即擁有利用 f2py
指令並具有最少多餘重複的綁定。
! -*- f90 -*-
! Note: the context of this file is case sensitive.
python module adder ! in
interface ! in :adder
module adder ! in :adder:adder_base.f90
#:def add_subroutine(dtype_prefix, dtype)
subroutine ${dtype_prefix}$add(a,b,c,n) ! in :adder:adder_base.f90:adder
integer intent(hide),depend(a) :: n=len(a)
${dtype}$ dimension(n),intent(in) :: a
${dtype}$ dimension(n),intent(in),depend(n) :: b
${dtype}$ dimension(n),intent(out),depend(n) :: c
end subroutine ${dtype_prefix}$add
#:enddef
#:for dtype_prefix, dtype in [('i', 'integer'), ('s', 'real'), ('d', 'real(kind=8)'), ('c', 'complex'), ('z', 'complex(kind=8)')]
@:add_subroutine(${dtype_prefix}$, ${dtype}$)
#:endfor
end module adder
end interface
end python module adder
! This file was auto-generated with f2py (version:2.0.0.dev0+git20240101.bab7280).
! See:
! https://numpy.dev.org.tw/doc/stable/f2py/
使用方式歸結為
fypp gen_adder.f90.fypp > adder.f90
fypp adder.pyf.fypp > adder.pyf
f2py -m adder -c adder.pyf adder.f90 --backend meson